Le nouvel aileron immense de Méga-Aligatueur possède plusieurs fonctions.

Il lui offre tout d’abord un boost défensif. Le Pokémon peut en effet recouvrir sa tête avec, et ainsi réduire les dégâts des attaques physiques qu’il subit. Il lui permet également de mieux dissiper la chaleur. La Méga-Évolution fait en effet rapidement monter la température corporelle des Pokémon. L’aileron de Méga-Aligatueur lui permet de se rafraîchir en évacuant cette chaleur.

Pour une raison qui nous échappe, l’aileron dorsal de Méga-Aligatueur ressemble à s’y méprendre à la tête de Kaiminus. Certains le surnomment d’ailleurs « masque de Kaiminus ».

Une théorie prétend que la Méga-Évolution a doté Aligatueur de ce masque pour lui donner la force de morsure de Kaiminus, dont la mâchoire possède une forme optimale pour broyer n’importe quoi. Cela dit, nul ne sait si cette théorie est vraie.